आटोक्लेव में डिब्बाबंद टूना कंटेनरों को कंटेनरों के संपर्क के बाद 0.5 से 2.0 पीपीएम के अवशिष्ट मुक्त क्लोरीन के साथ क्लोरीनयुक्त पानी का उपयोग करके ठंडा किया जाना चाहिए। परिरक्षित पदार्थों के प्रत्येक निष्फल बैच के लिए इस क्लोरीन सांद्रता का सख्त नियंत्रण करना महत्वपूर्ण है। ठंडा करना बहुत तेज़ होना चाहिए, कंटेनर के आकार के आधार पर, 10 मिनट से कम समय में कंटेनर के केंद्र में 40 डिग्री सेल्सियस या उससे कम तक पहुंचना चाहिए। यह प्रक्रिया थर्मोफिलिक सूक्ष्मजीवों के बीजाणुओं को रोकने के लिए महत्वपूर्ण है जो नसबंदी प्रक्रिया से बचकर व्यवहार्य कोशिकाओं में परिवर्तित हो जाते हैं जो पैक किए गए उत्पाद को बदल देते हैं। इसके अलावा, पर्याप्त शीतलन डिब्बे को नम होने और ऑक्सीकरण के खतरे से बचाने में मदद करता है।
आटोक्लेव में ठंडा करने के दौरान कंटेनरों के विरूपण से बचने के लिए, संपीड़ित हवा के साथ 10 – 12 lb/in^2 के दबाव पर क्लोरीनयुक्त पीने योग्य पानी के उपयोग की सिफारिश की जाती है। अंतिम शीतलन तापमान 35 डिग्री सेल्सियस से कम होना चाहिए, और सीलबंद और गर्मी-संसाधित कंटेनर की अखंडता की रक्षा के लिए ठंडा करने के बाद कंटेनरों को सावधानीपूर्वक संभालना महत्वपूर्ण है।
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